患兒初生時多無特殊臨床表現(xiàn),一般3~4個月后才逐漸出現(xiàn)癥狀,開始出現(xiàn)嘔吐、易激惹、神經(jīng)運動發(fā)育落后等現(xiàn)象。神經(jīng)系統(tǒng)以智力發(fā)育落后為主,嚴重程度不盡相同,約60%屬于重型智力低下,可表現(xiàn)為精神行為異常,如興奮不安、多動、攻擊性行為等。約1/4有癲癇發(fā)作,常于18個月之前發(fā)生,80%伴腦電圖異常;少數(shù)可有小頭畸形,肌張力增高,步態(tài)異常,腱反射亢進,手部細微震顫和肢體重復動作等。BH4缺乏型則癥狀出現(xiàn)早、癥狀重,常表現(xiàn)為肌張力明顯減低,軟弱無力,難以控制的驚厥,明顯智力落后,不治療常在幼兒期死亡。約90%患兒在出生數(shù)月后因色素合成不足,毛發(fā)、皮膚和虹膜色澤變淺。約1/3患兒皮膚干燥,常有濕疹,甚至持續(xù)數(shù)年。由于患兒尿和體液中排出苯乙酸,故有特殊的鼠尿樣臭味。其實驗室檢查可以行尿三氯化鐵試驗,用于較大嬰兒的篩查;還可以行血苯丙氨酸和酪氨酸生化定量檢查,正常人血苯丙氨酸濃度為0.06~0.18mmol/L,典型苯丙酮尿癥患兒生后乳類喂養(yǎng)數(shù)日后,血苯丙氨酸持續(xù)在1.22mmol/L以上,凡經(jīng)新生兒篩查結(jié)果為陽性者都需經(jīng)過此項檢查加以確診;還可以進行酶學檢查和DNA分析以及影像學檢查(CT和MRI)協(xié)助診斷。